Existen numerosas bases de datos de estructuras químicas, así como gran cantidad de formatos de archivo químicos. El sistema experto OpenBabel nos permitirá convertir entre los diversos formatos.
Recursos
- Linux4Chemistry: redbrick.dcu.ie/~noel/linux4chemistry/
Tabla periódica en Linux
En Linux tenemos varios programas que muestran la tabla periódica con muchos datos de cada elemento:
Equivalencias en Windows: EQTabla (enodisoft.tk).
- Kalzium (edu.kde.org/kalzium/, paquete kalzium): tabla periódica de KDE.
- GPeriodic (frantz.fi/software/gperiodic.php, paquete gperiodic): tabla periódica para GNOME.
- gElemental (kdau.com/projects/gelemental, paquete gelemental): tabla periódica coloreada con los datos de todos los elementos.
Modelado molecular en Linux
Los programas para modelado molecular pretenden simular, explicar o predecir la estructura tridimensional y las propiedades fisicoquímicas de las moléculas.
Equivalencias en Windows: Millsian (millsian.com), AgileMolecule (agilemolecule.com).
Existen numerosas bases de datos de estructuras químicas, así como gran cantidad de formatos de archivo químicos. El sistema experto OpenBabel nos permitirá convertir entre los diversos formatos.
Recursos
- Linux4Chemistry: redbrick.dcu.ie/~noel/linux4chemistry/
- Ghemical (bioinformatics.org/ghemical, paquete ghemical): programa para ‘modelado molecular’ integrado con OpenBabel (conversor de formatos de archivo químicos).
- Viewmol (viewmol.sourceforge.net, paquete viewmol): programa para ‘modelado molecular’.
- Gabedit (gabedit.sourceforge.net, paquete gabedit): programa para ‘modelado molecular’ interfaz de MPQC (paquete mpqc), GAMESS-US, Gaussian, Molcas, Molpro y Q-Chem.
Editores moleculares en Linux
Los editores moleculares: permiten dibujar y editar estructuras químicas, en 2D/3D.
Equivalencias en Windows: ISIS/Draw.
- Xdrawchem (xdrawchem.sourceforge.net, paquete xdrawchem): ‘editor molecular 2D’ integrado con el conversor de archivos químicos OpenBabel. Permite descargar estructuras moleculares de Internet dando el nombre, la fórmula o el número CAS.
- ChemTool (ruby.chemie.uni-freiburg.de/~martin/chemtool/, paquete chemtool): ‘editor molecular 2D’.
- GChemPaint (nongnu.org/gchempaint/, paquete gchempaint): ‘editor molecular 2D’ para GNOME. Visualiza directamente en Ghemical.
- EasyChem (easychem.sourceforge.net, paquete easychem): ‘editor molecular 2D’.
Visualizadores moleculares en Linux
Los visualizadores moleculares: su objetivo es la representación gráfica de una molécula y de sus propiedades.
Equivalencias en Windows: Sirius.
- PyMOL (pymol.sourceforge.net, paquete pymol): ‘visualizador molecular’ escrito en Python.
- GDIS (gdis.sourceforge.net, paquete gdis): ‘visualizador molecular’.
- XMakemol (nongnu.org/xmakemol/, paquete xmakemol): ‘visualizador molecular’.
- RasMol (rasmol.org, paquete rasmol): ‘visualizador molecular’ orientado a macromoléculas orgánicas.
gracias por la info, esta buena. Sin embargo solo como una pequeña critica seria bueno que especifiques los tipos de métodos y los métodos con los que cuentan (MM, semi-emp, ab-initio, etc.).
De todas maneras probare algunos de ellos que no conocía ;).
la informacion me ayudo un poco, pero siento que les hace falta especificar un poco más para que se entienda un poco más
Pero esta todo bien
Gracias!!
Necesito un programa donde yo nomas ponga el nombre de la molecula y ya me salga modelada, sin tener que hacerla yo
Donde lo encuentro?
Me urge!!
es bueno para poder aprender sobre las macromoleculas